More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1205 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 713 aa  1452    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  55.59 
 
 		 740 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  68.39 
 
 		 708 aa  510  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  43.56 
 
 		 779 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 		 730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.43 
 
 		 731 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 741 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2682  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 723 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 730 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  38.62 
 
 		 778 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  57.67 
 
 		 650 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 		 563 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  56.85 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 		 563 aa  351  3e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  53.41 
 
 		 656 aa  349  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  40.97 
 
 		 656 aa  336  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  52.2 
 
 		 566 aa  323  5e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 713 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 		 823 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0346871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  30.1 
 
 		 712 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.51 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 699 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 		 652 aa  303  8.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  30.28 
 
 		 714 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  29.96 
 
 		 714 aa  300  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.4 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  30.01 
 
 		 738 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 716 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 714 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.06 
 
 		 695 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.85 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.71 
 
 		 714 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 627 aa  283  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 714 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 		 714 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 625 aa  276  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 712 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 		 715 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 621 aa  263  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  43.13 
 
 		 536 aa  259  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.97 
 
 		 688 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 688 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0585  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.67 
 
 		 706 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000132912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.11 
 
 		 705 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.68 
 
 		 716 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 707 aa  233  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  33.22 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 		 706 aa  230  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.81 
 
 		 705 aa  227  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  27.13 
 
 		 706 aa  226  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.61 
 
 		 706 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 706 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  26.94 
 
 		 706 aa  224  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  29.01 
 
 		 701 aa  223  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.26 
 
 		 706 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.26 
 
 		 706 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.26 
 
 		 706 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 		 705 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 530 aa  221  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  28.91 
 
 		 697 aa  221  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  28.49 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 		 706 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  27.6 
 
 		 720 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.57 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.59 
 
 		 649 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.127099 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  29.76 
 
 		 698 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.59 
 
 		 667 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  29.87 
 
 		 744 aa  207  7e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  29.78 
 
 		 682 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 706 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3926  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.8 
 
 		 665 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 		 720 aa  197  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.58 
 
 		 657 aa  193  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.9 
 
 		 720 aa  193  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.76 
 
 		 571 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  27 
 
 		 704 aa  187  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 		 530 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 634 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 		 628 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.62 
 
 		 628 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.45 
 
 		 643 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.29 
 
 		 630 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.44 
 
 		 785 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.79 
 
 		 630 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.18 
 
 		 549 aa  177  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.47 
 
 		 626 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  29.36 
 
 		 632 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 629 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  28.79 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  27.78 
 
 		 632 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 647 aa  171  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  31.7 
 
 		 634 aa  170  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 638 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>