43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1191 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  51.96 
 
 
202 aa  206  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  44.5 
 
 
207 aa  168  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  44.5 
 
 
207 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  39.27 
 
 
199 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  27.75 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  29.8 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  28.29 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  28.08 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  28.9 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.08 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  30 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  27.07 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  29.08 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  27.75 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.8 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.8 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.84 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.23 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.8 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.8 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  26.8 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  26.8 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  26.8 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.91 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  23.27 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.67 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  25.91 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  24.29 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.76 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  27.12 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.12 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4205  hypothetical protein  23.74 
 
 
208 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.55 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.13 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  23.58 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  23.53 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.69 
 
 
205 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  26.34 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>