More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1098 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  65.47 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  65.59 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  62.15 
 
 		 283 aa  360  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  61.3 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  60.66 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  58.8 
 
 		 281 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  58.12 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  60.66 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  56.83 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  58.82 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  58.25 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  58.09 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  58.09 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  58.09 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  59.07 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  57.25 
 
 		 253 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  55.56 
 
 		 244 aa  301  8.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  56.12 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  58.7 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  54.71 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  54.84 
 
 		 247 aa  295  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  56.99 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  54.48 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  55 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  54.12 
 
 		 246 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  48 
 
 		 277 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  55.76 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  44.8 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  47.33 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  43.19 
 
 		 326 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  47.29 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  44.89 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  39.88 
 
 		 352 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  42.55 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  44.16 
 
 		 267 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  56.06 
 
 		 248 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  45.91 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  41.46 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  51.82 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  41.86 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  44.04 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  41.87 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  41.94 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  41.94 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.44 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.03 
 
 		 290 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  48 
 
 		 308 aa  222  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.03 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.03 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.03 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.03 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  42.91 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  45.55 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  42.51 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  46.7 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  42.16 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  41.61 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  45.61 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  44.96 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  43.9 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  45.2 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  40.94 
 
 		 345 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.11 
 
 		 303 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  42.56 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  42.97 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  44.49 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  43.14 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  51.66 
 
 		 254 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.49 
 
 		 252 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  43.15 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  50.98 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.76 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  50.49 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  49.04 
 
 		 218 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  51.96 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  51.72 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  40.8 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  49.04 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 224 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  46.7 
 
 		 222 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  50.46 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  43.44 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 218 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.29 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  46.12 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  47.12 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  47.6 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>