203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1094 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  100 
 
 
113 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  55.75 
 
 
113 aa  143  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  53.98 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  51.79 
 
 
113 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  56.64 
 
 
118 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  53.98 
 
 
117 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  53.98 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1911  hydrogenase nickel insertion protein HypA  53.1 
 
 
117 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0043415  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2415  hydrogenase nickel insertion protein HypA  52.21 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774419  hitchhiker  0.0000872958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  54.87 
 
 
118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  54.87 
 
 
118 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  52.21 
 
 
117 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  53.98 
 
 
115 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  54.87 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  56.64 
 
 
114 aa  125  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  50.44 
 
 
115 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2113  hydrogenase expression/synthesis, HypA  51.33 
 
 
114 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00315228  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  46.73 
 
 
115 aa  120  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2023  hydrogenase expression/synthesis HypA  50.89 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  50.45 
 
 
121 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  46.43 
 
 
121 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  47.79 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1755  hydrogenase expression/synthesis, HypA  53 
 
 
116 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0656  hydrogenase nickel insertion protein HypA  42.98 
 
 
114 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0730  hydrogenase nickel insertion protein HypA  42.98 
 
 
114 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.525466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.59 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1042  hydrogenase nickel insertion protein HypA  42.11 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  43.36 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  39.82 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.82 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  36.61 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.51 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.94 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1886  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.45 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.552907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.5 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.97 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.09 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.43 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.82 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.73 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.51 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0514  hydrogenase expression/synthesis HypA  30 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0729285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0472  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.79 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0500  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.74 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.74 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2182  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.93 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0505  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.68 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4500  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.91 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.74 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.93 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4944  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000180584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.32 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.67 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.36 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.58 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  32.74 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.97 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.95 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  30.7 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00349  hydrogenase expression/formation protein HypA  33.33 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3199  hydrogenase nickel incorporation protein  28.95 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.66 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1382  hydrogenase expression/formation protein HypA  31.07 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00630275  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.93 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.72 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03870  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.82 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.32 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.1 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2006  hydrogenase expression/formation  30 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321644  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.2 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.57 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1964  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.18 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3059  hydrogenase nickel incorporation protein  29.82 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606667  normal  0.0829124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>