More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1067 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 410 aa  810    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  60.6 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  57.66 
 
 		 443 aa  481  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  61.43 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  57.25 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  57.25 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  57.25 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  57.46 
 
 		 432 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  57.71 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  57.04 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  57.04 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  55.94 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  57.04 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  56.55 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  56.13 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  56.19 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  48.64 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  47.9 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  47.54 
 
 		 413 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  47.17 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  43.74 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  44.6 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  47.41 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  44.02 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  45.86 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  50.51 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  44.07 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  44.07 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  44.55 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  43.83 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  43.83 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 419 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 419 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  48.16 
 
 		 426 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  44.88 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  47.42 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  43.43 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  47.9 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  47.9 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  42.69 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  47.65 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.35 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  43.41 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  43.99 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.69 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  42.37 
 
 		 439 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  47.17 
 
 		 419 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  47.65 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  42.21 
 
 		 434 aa  342  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  43.06 
 
 		 457 aa  342  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  42.45 
 
 		 434 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  45.55 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  42.89 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  42.58 
 
 		 457 aa  338  8e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  43.2 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  43.87 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  43.63 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.87 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  43.63 
 
 		 411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  43.81 
 
 		 413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  43.63 
 
 		 411 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.63 
 
 		 411 aa  326  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  43.63 
 
 		 411 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  43.63 
 
 		 411 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  42.96 
 
 		 452 aa  325  7e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  43.87 
 
 		 411 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  43.38 
 
 		 411 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  43.03 
 
 		 457 aa  322  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  40.55 
 
 		 411 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  41.05 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  42.14 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  44.74 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  44.42 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  43.41 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.71 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  40.82 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.35 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  40.56 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.77 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  39.18 
 
 		 423 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  39.18 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  38.94 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  38.94 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  38.94 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.31 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  38.94 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  38.94 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  38.7 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  38.7 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  38.97 
 
 		 408 aa  279  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  38.73 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  36.74 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>