More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1029 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  288  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  63.51 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  60.14 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  61.49 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  56.38 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  52.7 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.03 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 153 aa  105  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 149 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  40.6 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.85 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  33.56 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  31.03 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  31.08 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.57 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  34.87 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36.18 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  31.76 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  31.08 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  33.56 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  36.18 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  38.06 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.73 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.18 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  35.95 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  30.34 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  32.43 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  28.77 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  34.59 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  31.72 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  39.55 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  34.56 
 
 		 191 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  34.21 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  32.24 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>