More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0984 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  45.83 
 
 		 731 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  48.22 
 
 		 725 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  45.66 
 
 		 728 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  48.08 
 
 		 720 aa  673    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  47.57 
 
 		 720 aa  650    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 700 aa  1425    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  47.08 
 
 		 753 aa  646    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  48.56 
 
 		 705 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  49.07 
 
 		 731 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  64.23 
 
 		 699 aa  921    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  48.42 
 
 		 743 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 720 aa  648    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  47.28 
 
 		 712 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  47.03 
 
 		 750 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  44.67 
 
 		 728 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  45.96 
 
 		 726 aa  631  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  43.94 
 
 		 724 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.64 
 
 		 739 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  43.94 
 
 		 724 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  45.72 
 
 		 706 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  44.32 
 
 		 720 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  43.14 
 
 		 721 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.38 
 
 		 717 aa  585  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  48.02 
 
 		 892 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  48.18 
 
 		 865 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  42.36 
 
 		 739 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  42.21 
 
 		 741 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  43.85 
 
 		 726 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  43.41 
 
 		 1024 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.43 
 
 		 1003 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.64 
 
 		 1001 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  45.83 
 
 		 1008 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  45.83 
 
 		 1008 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.23 
 
 		 1000 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  41.32 
 
 		 1038 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  40.85 
 
 		 1038 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  40.47 
 
 		 719 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  42.62 
 
 		 1019 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.74 
 
 		 971 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  37.91 
 
 		 714 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  37.77 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  43.84 
 
 		 930 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  37.8 
 
 		 980 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.84 
 
 		 976 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43 
 
 		 999 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  41.31 
 
 		 714 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  44.22 
 
 		 975 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 1006 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  40 
 
 		 986 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  37.22 
 
 		 712 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  37.07 
 
 		 712 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  37.07 
 
 		 712 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  45.29 
 
 		 523 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  41.6 
 
 		 715 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  39 
 
 		 908 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.18 
 
 		 908 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.6 
 
 		 715 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  38.86 
 
 		 740 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.75 
 
 		 1013 aa  479  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  36.79 
 
 		 740 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 		 906 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.5 
 
 		 1012 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 		 906 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  41.85 
 
 		 730 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.48 
 
 		 1016 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  38.76 
 
 		 1013 aa  465  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  38.75 
 
 		 968 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  39.4 
 
 		 1011 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  37.13 
 
 		 1042 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  35.86 
 
 		 1040 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.8 
 
 		 1018 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.12 
 
 		 1018 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.86 
 
 		 736 aa  429  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  39.96 
 
 		 1018 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  36.58 
 
 		 724 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  37.06 
 
 		 982 aa  426  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  36.58 
 
 		 724 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  33 
 
 		 744 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  32.58 
 
 		 744 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  32.31 
 
 		 741 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.28 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  35.02 
 
 		 767 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  36.82 
 
 		 742 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  37.06 
 
 		 721 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.01 
 
 		 759 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.95 
 
 		 717 aa  362  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  48.48 
 
 		 368 aa  360  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  33.43 
 
 		 727 aa  360  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.67 
 
 		 726 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  32.79 
 
 		 762 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  33.44 
 
 		 734 aa  357  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  33.04 
 
 		 727 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.97 
 
 		 597 aa  352  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.75 
 
 		 731 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  33.13 
 
 		 734 aa  349  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  32.31 
 
 		 776 aa  346  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.94 
 
 		 738 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  32.92 
 
 		 734 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  33.82 
 
 		 704 aa  344  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  34.3 
 
 		 718 aa  343  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>