More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0979 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1177  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.6 
 
 		 1005 aa  809    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  44.61 
 
 		 1008 aa  789    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  37.95 
 
 		 1028 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1009 aa  2024    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  51.78 
 
 		 1013 aa  1016    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  38.36 
 
 		 1028 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0988  integral membrane component of efflux system  42.72 
 
 		 1004 aa  785    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0749  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.4 
 
 		 1005 aa  805    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1052  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.5 
 
 		 1005 aa  805    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1055 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 		 1028 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1095 aa  595  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.96 
 
 		 1069 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  36.53 
 
 		 1028 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1070 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1065 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1071 aa  569  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 		 1039 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.9 
 
 		 1496 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1075 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1029 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1038 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1041 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1066 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1036 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1032 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1050 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1014 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1047 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.11 
 
 		 1024 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1022 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1031 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1033 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1045 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1062 aa  528  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 		 1011 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1054 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1022 aa  525  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1039 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 		 1044 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1043 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  31.71 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1054 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1031 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1054 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1038 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1037 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1026 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1034 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1067 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1042 aa  509  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1048 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1033 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1037 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1055 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1059 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1037 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1040 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1040 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.43 
 
 		 1050 aa  498  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  30.74 
 
 		 1068 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1058 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1088 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.66 
 
 		 1036 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1060 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1035 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  30.88 
 
 		 1026 aa  495  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1050 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1032 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1048 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1058 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1055 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1048 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1037 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1058 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1043 aa  489  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1037 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1031 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1103 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1044 aa  486  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  29.84 
 
 		 1026 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  29.88 
 
 		 1026 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1042 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1073 aa  484  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1042 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1053 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1034 aa  482  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1088 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1031 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  30.31 
 
 		 1088 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  29.46 
 
 		 1030 aa  482  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1063 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1058 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1044 aa  483  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1031 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1031 aa  482  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1031 aa  482  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1064 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>