149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0903 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
334 aa  686    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  63.11 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  65.53 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  61.89 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  41.9 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.07 
 
 
338 aa  258  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  41.57 
 
 
333 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  39.14 
 
 
331 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  42.25 
 
 
333 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  42.02 
 
 
331 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  40.37 
 
 
330 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.98 
 
 
331 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.92 
 
 
331 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  41.44 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.73 
 
 
330 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.18 
 
 
321 aa  241  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.28 
 
 
330 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.1 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  40.12 
 
 
331 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  38.32 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  35.47 
 
 
330 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.41 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  41.21 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.92 
 
 
330 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.01 
 
 
327 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  37.32 
 
 
360 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  38.04 
 
 
330 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.07 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  37.15 
 
 
321 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  34.45 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.55 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  38.61 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.66 
 
 
319 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  37.85 
 
 
384 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  35.06 
 
 
330 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  38.61 
 
 
259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.42 
 
 
329 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  30.58 
 
 
331 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.13 
 
 
328 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.14 
 
 
326 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  27.74 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 
325 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 
325 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 
325 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  27.57 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 
332 aa  116  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.75 
 
 
330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.86 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  24.54 
 
 
325 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  26.47 
 
 
545 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.46 
 
 
570 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.35 
 
 
343 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.67 
 
 
598 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 
338 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  27.92 
 
 
339 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.84 
 
 
350 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  25.44 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  26.35 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  28.78 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.53 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.16 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.5 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  23.1 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  25 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  27.36 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  25.42 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  24.8 
 
 
558 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  22.74 
 
 
344 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.12 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  29.55 
 
 
326 aa  92.8  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.32 
 
 
559 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  23.34 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  26.97 
 
 
594 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.15 
 
 
550 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.07 
 
 
342 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 
346 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.44 
 
 
341 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.32 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0915  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.11 
 
 
186 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00714947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  23.17 
 
 
343 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  30.39 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  25.59 
 
 
525 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.15 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.23 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.09 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.39 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.09 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.57 
 
 
544 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  23.08 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  25.42 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.68 
 
 
731 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.12 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  22.44 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.99 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.54 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  21.74 
 
 
553 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  26.6 
 
 
727 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.63 
 
 
580 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>