More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0863 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  100 
 
 		 132 aa  263  8e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  57.72 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  57.38 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  57.38 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  56.56 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  58.65 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  53.1 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  53.1 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  38.78 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  31.15 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  31.3 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  32.74 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  28.81 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  30.23 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  32.74 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  39.78 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  31.86 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  30.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  27.08 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  29.92 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  27.37 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>