49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0822 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  100 
 
 
310 aa  620  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  39.94 
 
 
422 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  43.33 
 
 
364 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  42.72 
 
 
345 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  41.89 
 
 
371 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  37.14 
 
 
354 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  42.72 
 
 
351 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  38.68 
 
 
351 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  40.67 
 
 
346 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  34.85 
 
 
327 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  36.02 
 
 
359 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  38.1 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  36.6 
 
 
435 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  35.47 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  34.08 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  34.12 
 
 
618 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  38.1 
 
 
940 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  36.04 
 
 
1112 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 
844 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  38.1 
 
 
1789 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.72 
 
 
4687 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  29.19 
 
 
541 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  36.52 
 
 
959 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.74 
 
 
999 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  32.06 
 
 
928 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  37.74 
 
 
1480 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.33 
 
 
677 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  33.86 
 
 
428 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  33.07 
 
 
548 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  40.23 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  33.33 
 
 
532 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.36 
 
 
1925 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.51 
 
 
3598 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.27 
 
 
4798 aa  62.8  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.45 
 
 
1499 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  30.99 
 
 
582 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.3 
 
 
466 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  29.73 
 
 
679 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  37.37 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  34.29 
 
 
1814 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.29 
 
 
2107 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  46.15 
 
 
435 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  29.58 
 
 
585 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  34.31 
 
 
1306 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  27.69 
 
 
1809 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
2296 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.73 
 
 
1607 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  34.29 
 
 
960 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.2 
 
 
1544 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>