More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0819 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
627 aa  1261    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  79.11 
 
 
625 aa  978    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  64.97 
 
 
621 aa  804    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
713 aa  283  8.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  33.44 
 
 
626 aa  282  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
563 aa  280  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
650 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 
708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 
563 aa  257  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.39 
 
 
632 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  36.91 
 
 
656 aa  251  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
563 aa  249  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  43.49 
 
 
566 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  29.94 
 
 
629 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  29.08 
 
 
632 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 
682 aa  238  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  33.46 
 
 
627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  33.03 
 
 
627 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  29.32 
 
 
632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 
625 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
652 aa  234  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  29.47 
 
 
629 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  32.24 
 
 
652 aa  230  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  29.5 
 
 
623 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  27.7 
 
 
629 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  27.7 
 
 
629 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  26.82 
 
 
643 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 
632 aa  223  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.58 
 
 
630 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.19 
 
 
626 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  29.32 
 
 
639 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.34 
 
 
628 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  32.72 
 
 
624 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 
636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 
628 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.01 
 
 
626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.65 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 
622 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.08 
 
 
643 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  26.75 
 
 
629 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 
626 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.14 
 
 
630 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  27.09 
 
 
623 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3307  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  27.44 
 
 
646 aa  210  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154231  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
647 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.8 
 
 
629 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 
633 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 
622 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  29.68 
 
 
626 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.83 
 
 
633 aa  203  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  31.59 
 
 
636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.19 
 
 
608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 
627 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  32.31 
 
 
655 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  32.31 
 
 
655 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.32 
 
 
599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.15 
 
 
622 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.19 
 
 
609 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 
629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 
630 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  25.88 
 
 
617 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.32 
 
 
599 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.63 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.23 
 
 
624 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.46 
 
 
677 aa  197  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.84 
 
 
624 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.01 
 
 
600 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.69 
 
 
624 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 
596 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 
599 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.44 
 
 
630 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 
599 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.48 
 
 
630 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 
630 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.92 
 
 
599 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.69 
 
 
624 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 
660 aa  194  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  30.67 
 
 
623 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.4 
 
 
660 aa  194  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.29 
 
 
630 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6319  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.51 
 
 
601 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  25.57 
 
 
628 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 
530 aa  192  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  29.63 
 
 
601 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  27.03 
 
 
658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 
599 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.33 
 
 
600 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0503971  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 
536 aa  190  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.6 
 
 
596 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  25.34 
 
 
630 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 
626 aa  189  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3471  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.16 
 
 
605 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  27.01 
 
 
658 aa  187  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.88 
 
 
596 aa  187  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
530 aa  186  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.92 
 
 
658 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  27.03 
 
 
658 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>