86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0799 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  48.73 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  47.46 
 
 
289 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  46.38 
 
 
253 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  44.77 
 
 
262 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  45.34 
 
 
266 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  45.76 
 
 
266 aa  208  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  43.64 
 
 
258 aa  207  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  44.92 
 
 
253 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  45.96 
 
 
252 aa  205  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  45.76 
 
 
253 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  45.34 
 
 
253 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  43.64 
 
 
252 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  44.21 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  44.21 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  44.21 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  44.49 
 
 
253 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  44.49 
 
 
253 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  44.07 
 
 
258 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  43.51 
 
 
260 aa  198  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  44.92 
 
 
253 aa  198  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  46.19 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  46.61 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  42.68 
 
 
273 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  44.26 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  42.68 
 
 
279 aa  195  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  44.26 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  44.26 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  43.1 
 
 
258 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  44.35 
 
 
266 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  44.26 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  41.18 
 
 
314 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  41.18 
 
 
303 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  41.84 
 
 
274 aa  188  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  41.53 
 
 
314 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  41.53 
 
 
314 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  41.53 
 
 
314 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  42.02 
 
 
277 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  42.02 
 
 
256 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  42.02 
 
 
277 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  41.84 
 
 
277 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  42.02 
 
 
256 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  42.02 
 
 
256 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  42.02 
 
 
256 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  42.02 
 
 
274 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  45.11 
 
 
253 aa  185  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  40.24 
 
 
268 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  40.34 
 
 
261 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  38.93 
 
 
267 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  37.92 
 
 
262 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  29.75 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  28.51 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  26.96 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  22.97 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  26.53 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  25.12 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  28.76 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  24.58 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  29.18 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.71 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  23.24 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  30.58 
 
 
258 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  30.58 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.67 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  29.37 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  22.55 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  33.04 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.28 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.28 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  25.82 
 
 
420 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.97 
 
 
426 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  23.48 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  26.67 
 
 
440 aa  52  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  22.44 
 
 
634 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  23.83 
 
 
422 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  23.67 
 
 
415 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  21.1 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  23.6 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  23.83 
 
 
254 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  25.44 
 
 
511 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  23.83 
 
 
254 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  23.28 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  22.13 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  22.13 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  25.31 
 
 
573 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>