More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0756 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  100 
 
 
88 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  70.45 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  69.32 
 
 
86 aa  122  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  59.09 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  61.36 
 
 
86 aa  110  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  56.82 
 
 
86 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0700  co-chaperonin GroES  62.92 
 
 
87 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0190508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  57.45 
 
 
95 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  56.18 
 
 
87 aa  100  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000722404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
95 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  50 
 
 
104 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  51.69 
 
 
92 aa  87.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  50 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 
91 aa  87.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  50 
 
 
96 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  50 
 
 
96 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  50 
 
 
96 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
104 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
96 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  50.56 
 
 
92 aa  86.7  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  46.81 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  50 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
98 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
97 aa  84.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  51.06 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  48.89 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  45.74 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
96 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 
98 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
104 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
95 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  50.56 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>