More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0736 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  38.33 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  32.41 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  32.41 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  35 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  31.48 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  34.88 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  32.3 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  31.48 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  33.64 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  28.76 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  35.02 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  30.59 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  30.32 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.24 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 652 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  27.98 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  26.7 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.64 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  31.94 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  28.97 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  30.73 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  28.97 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  32.13 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.91 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.64 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  28.05 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  29.02 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  29.03 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3615  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.0901376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  26.64 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.64 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  29.46 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  33.33 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  29.03 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  29.87 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  27.03 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1981  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  28.9 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  29.95 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  28.07 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  27.15 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  28.64 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.45 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0139  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315235  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  27.19 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.68 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  29.49 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.79 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  26.91 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.83 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>