45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0715 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  100 
 
 		 451 aa  898    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  51.21 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  45.12 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  43.11 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  40.21 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  40.52 
 
 		 407 aa  237  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  35.99 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  33.98 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  28.98 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  29.89 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  28.81 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  26.44 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  26.49 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  26.6 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  24.24 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  26.08 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  26.21 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  25.43 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  24.09 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  27.55 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  30.32 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  33.12 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  27.55 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  24.38 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  24.48 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  25.36 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  22.58 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  23.12 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  26.03 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  26.03 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  24.21 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  24.42 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  27.97 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  26.71 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  23.23 
 
 		 417 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  28.27 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  26.18 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  32.47 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  26.49 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  23.4 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  25.95 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  25.13 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  24.36 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  28.11 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  21.29 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>