More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0685 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  31.56 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  33.33 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  29.02 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  32.73 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.23 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  29.68 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  29.73 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  32.14 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  26.55 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  26.99 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  25.56 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  27.15 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  28.11 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.3 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  32.26 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  27.4 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  24.89 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  29.49 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  30.53 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  29.46 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3430  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.15 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  29.78 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  29.33 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.73 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  22.62 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  28.33 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.13 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  28.18 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.18 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  27.4 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.58 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.52 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  28.31 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.05 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  27.4 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4359  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 219 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 375 aa  88.2  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.93 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  26.64 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.93 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  28.32 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.18 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  28.15 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  28.31 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  27.85 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 799 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  29.68 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  28.31 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  25.45 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.31 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 566 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3034  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  28.31 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>