More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0607 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0866  argininosuccinate lyase  69.28 
 
 
460 aa  687    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  100 
 
 
463 aa  954    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  63.54 
 
 
467 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  62.14 
 
 
466 aa  590  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  61.9 
 
 
504 aa  588  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  61.22 
 
 
460 aa  580  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0938  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 
460 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  55.99 
 
 
460 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  58.57 
 
 
458 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 
458 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0883  argininosuccinate lyase  55.46 
 
 
460 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  55.41 
 
 
458 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  56.82 
 
 
458 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
458 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  54.57 
 
 
458 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.68 
 
 
460 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  52.72 
 
 
467 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 
467 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  54.77 
 
 
462 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  53.79 
 
 
461 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  52.12 
 
 
493 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  52.64 
 
 
466 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  55.2 
 
 
462 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  52.12 
 
 
466 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
462 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 
462 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
462 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 
473 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  52.2 
 
 
467 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  55.2 
 
 
462 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 
463 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
462 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
463 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  52.25 
 
 
456 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  52.12 
 
 
478 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
466 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
461 aa  482  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  53.88 
 
 
459 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  55.08 
 
 
475 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  54.75 
 
 
462 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 
467 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  53.88 
 
 
462 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 
471 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  53.39 
 
 
469 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
460 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  54.05 
 
 
470 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 
471 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  52.78 
 
 
458 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  52.18 
 
 
460 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  51.87 
 
 
460 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  52.43 
 
 
464 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  51.57 
 
 
471 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  52.89 
 
 
467 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 
476 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  51 
 
 
469 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
466 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  51.56 
 
 
461 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  52.57 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  50.63 
 
 
493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.05 
 
 
468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
485 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  52.35 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  52.57 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  51.63 
 
 
476 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  51.69 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  52.73 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  51.34 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  52.34 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  52.7 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  52.12 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  52.9 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.34 
 
 
467 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  52.67 
 
 
459 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 
464 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  51.67 
 
 
464 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
441 aa  461  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  51.47 
 
 
466 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  52.49 
 
 
481 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
463 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  51.81 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
486 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
485 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  51.35 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  51.58 
 
 
489 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  48.91 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  52.04 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
486 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>