More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0504 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 368 aa  753    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  60.38 
 
 		 369 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  60.45 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  61.43 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  58.08 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  57.1 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  56.32 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  56.32 
 
 		 350 aa  345  6e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  56.04 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.38 
 
 		 426 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.98 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.79 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  53.31 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.18 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  50.86 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.18 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  52.41 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  42.74 
 
 		 407 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  48.67 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  45.71 
 
 		 407 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  44.86 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  43.58 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  43.58 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  43.58 
 
 		 408 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.57 
 
 		 334 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.34 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  43.75 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.31 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.58 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  46.01 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  51.22 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.85 
 
 		 408 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  48.78 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.55 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  48.78 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.52 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 428 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  43.17 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  50.17 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  45.73 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.17 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.5 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  43.05 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.17 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  44.97 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.41 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  53.12 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  53.26 
 
 		 432 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  48.7 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  43.01 
 
 		 430 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  43.01 
 
 		 430 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.5 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.06 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.76 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  49.66 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  44.66 
 
 		 439 aa  255  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  49.65 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.53 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.5 
 
 		 434 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  51.88 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  50.98 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  50.98 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.19 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  44.04 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  49.66 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.35 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  43.73 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.63 
 
 		 415 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  51.19 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  46.84 
 
 		 345 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 338 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  48.65 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51 
 
 		 338 aa  252  7e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.71 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  48.28 
 
 		 439 aa  252  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.85 
 
 		 356 aa  251  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.7 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  48.59 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  50.18 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.72 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.17 
 
 		 680 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  50.17 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00015  GTPase ObgE  44.12 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  47.71 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  49.48 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.47 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.11 
 
 		 345 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.83 
 
 		 424 aa  248  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  50.34 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  45.59 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  50.17 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  49 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  50.7 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.8 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.33 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.53 
 
 		 426 aa  245  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>