More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0502 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 102 aa  146  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  69.31 
 
 		 104 aa  143  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  55.56 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.12 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.51 
 
 		 198 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>