55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0473 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  84.52 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  36.9 
 
 
86 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.56 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  34.12 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  35.29 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 
89 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  31.51 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  37.5 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  38.37 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.37 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  34.57 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  34.15 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  32.14 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.27 
 
 
712 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  32.14 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  39.44 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  32.94 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  37.21 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.59 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  34.09 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  36 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  34.09 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  36 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  34.94 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.15 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1648  hypothetical protein  33.8 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0597256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  33.71 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3874  plasmid stabilization system  29.76 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  28.57 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  34.09 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  31.03 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  30.12 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  32.47 
 
 
80 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 
201 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  36 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  27.78 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3279  hypothetical protein  26.09 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.741778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  28.92 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  30.38 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  32.31 
 
 
710 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  29.76 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  32.14 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.44 
 
 
89 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>