More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0448 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  40.99 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  37.67 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  34.55 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  33.33 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  28.83 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  32.11 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.36 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  28.76 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  30.67 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  30.7 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 517 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 502 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 258 aa  95.5  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  27.93 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 396 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.04 
 
 		 425 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 636 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.91 
 
 		 953 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 508 aa  89.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.62 
 
 		 953 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  30.4 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  26.79 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.99 
 
 		 438 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  30.84 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  28.37 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 476 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.12 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  28.32 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  28.76 
 
 		 248 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  28.32 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  28.32 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  26.04 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  28.22 
 
 		 269 aa  85.5  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.15 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.82 
 
 		 304 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  27.88 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.87 
 
 		 616 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  38.66 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2720  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  33.33 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.94 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.85 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  29.14 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.04 
 
 		 709 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  43.18 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  29.14 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.14 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.87 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  28.31 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.31 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  29.68 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  29.14 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  29.14 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  26.46 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  29.14 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  27.85 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.82 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>