More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0355 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  100 
 
 
125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000759048  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  93.55 
 
 
128 aa  236  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  93.55 
 
 
128 aa  236  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  93.55 
 
 
127 aa  236  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  93.55 
 
 
128 aa  236  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  93.5 
 
 
124 aa  234  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  94.31 
 
 
127 aa  234  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  90.4 
 
 
126 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0186  30S ribosomal protein S12  93.22 
 
 
132 aa  224  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00248726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
125 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  81.6 
 
 
125 aa  209  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
125 aa  209  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
125 aa  209  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
125 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 
125 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 
125 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
125 aa  208  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  78.4 
 
 
125 aa  207  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
125 aa  207  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
125 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 
124 aa  207  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
125 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
126 aa  207  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  206  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
124 aa  206  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 
125 aa  206  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
126 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  80.8 
 
 
125 aa  205  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
124 aa  204  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
125 aa  204  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
125 aa  205  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  80 
 
 
125 aa  205  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
127 aa  204  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  81.3 
 
 
142 aa  203  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5084  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  203  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000372419  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 
124 aa  203  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  203  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
154 aa  203  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  81.3 
 
 
135 aa  203  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  202  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  202  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  202  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
127 aa  202  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
124 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3440  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
124 aa  202  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000139403  hitchhiker  0.000104981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0449  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245069  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0621  ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  78.4 
 
 
126 aa  201  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  78.4 
 
 
126 aa  201  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4553  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0482  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00887343  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4754  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0069971  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
125 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
125 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
126 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
136 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0479  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135027  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  201  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  201  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  201  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  200  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 
125 aa  200  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  80.49 
 
 
125 aa  200  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
137 aa  200  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
127 aa  200  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
125 aa  200  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  200  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  200  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0416  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 
124 aa  199  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00364585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  79.2 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3759  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  197  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000474528  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3718  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  0.0746879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>