187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0316 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  54.15 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  51.84 
 
 		 300 aa  292  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  49.33 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  48.84 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  48.67 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  48.33 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  46.03 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  49.16 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  47.83 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  34.32 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  31.72 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.7 
 
 		 680 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 239 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 314 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  35.55 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  34.22 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  32.19 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  29.32 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.2 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  28.4 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  31.1 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  27.74 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  27.08 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  23.85 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.73 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.46 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  26.28 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.6 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.71 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.85 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.53 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.56 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02449  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.08 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3201  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.01 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.83 
 
 		 450 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.77 
 
 		 339 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.53 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.71 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.04 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.58 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.52 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.66 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.74 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.55 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.6 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0923  hypothetical protein  32.89 
 
 		 77 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000601668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.87 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.56 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  19.07 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.84 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.2 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  21.89 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.5 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.04 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.39 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.39 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.72 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.84 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>