More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0273 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 393 aa  806    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  38.92 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  38.52 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  34.12 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  36.91 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  41.76 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  38.28 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  28.84 
 
 		 371 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  28.75 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  38.28 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  36.71 
 
 		 629 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  29.17 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  30.2 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  31.25 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  29.25 
 
 		 427 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 436 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  29.52 
 
 		 256 aa  94  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  30.66 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  27.52 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  33.33 
 
 		 599 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  29.1 
 
 		 412 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  27.42 
 
 		 281 aa  89.7  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  25.56 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  25.56 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  29.49 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  27.13 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  26.36 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  25.56 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 608 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 703 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  27.35 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.17 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  26.89 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 592 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  23.97 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.25 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.25 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 591 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 781 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.25 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 763 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  25.56 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 587 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  28.7 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  27.75 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  23.93 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  27.71 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  27.39 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  25.57 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  26.91 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 		 768 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  27.03 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 		 768 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  24.26 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23920  histidine kinase  21.92 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000513114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>