More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0222 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  100 
 
 
139 aa  288  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
136 aa  147  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
136 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
136 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0344  FUR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
136 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.470674  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
136 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1354  peroxide stress regulator  48.18 
 
 
138 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  44.55 
 
 
166 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  42.86 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  33.81 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  33.81 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
142 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 
143 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  38.76 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  36.19 
 
 
134 aa  84  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 
134 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  36 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  34.29 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  44.33 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  37 
 
 
136 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
170 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  36.73 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  29.5 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  42.05 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  31.06 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  38.14 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  34.07 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  36.29 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  29.36 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  33.33 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  39.78 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  36.56 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.35 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  34.02 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  32.99 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  39.78 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1568  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  42 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  37.63 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1915  ferric uptake regulator family protein  32.67 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.934218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  33.94 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1277  ferric uptake regulator family protein  37.62 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000971648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  35.92 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  33.03 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  37 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  37.08 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  39.08 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  40.66 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  40.62 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  35.05 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  35.92 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1653  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>