More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0216 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  100 
 
 		 355 aa  736    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  66.39 
 
 		 358 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  64.25 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  64.8 
 
 		 359 aa  484  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  64.89 
 
 		 357 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  64.61 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  64.61 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  62.92 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  59.1 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  57.89 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  51.69 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  49.58 
 
 		 357 aa  358  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  41.31 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  41.6 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  41.6 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40.17 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.48 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  41.14 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.2 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.91 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  38.46 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.74 
 
 		 358 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  41.03 
 
 		 358 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.68 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.89 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.6 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  38.83 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  40.8 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  39.32 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.31 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.15 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  38.84 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.29 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.71 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.71 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.36 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.64 
 
 		 365 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  35.1 
 
 		 397 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.15 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.36 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.64 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.43 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.15 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.43 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  34.97 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.97 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  36.39 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.49 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.93 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  34.2 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  39.15 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.39 
 
 		 360 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  35.54 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  37.25 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  37.25 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  34.18 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  35.51 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.82 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  35.82 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  38.98 
 
 		 362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  33.24 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.37 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.53 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.53 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.24 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.56 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.94 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  35.03 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.84 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  33.52 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  34.72 
 
 		 706 aa  209  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  33.62 
 
 		 359 aa  209  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 358 aa  208  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.56 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  37.78 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.53 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.9 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  31.44 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.25 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  32.48 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  33.6 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  31.09 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  31.73 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  33.05 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  30.99 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>