More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0205 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  73.34 
 
 
769 aa  1155    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  72.95 
 
 
785 aa  1144    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  71.73 
 
 
783 aa  1122    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  64.59 
 
 
803 aa  1006    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  72.82 
 
 
770 aa  1140    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  73.34 
 
 
769 aa  1149    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  100 
 
 
774 aa  1546    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  74.49 
 
 
770 aa  1142    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  73.34 
 
 
769 aa  1155    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
770 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
604 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
603 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
607 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
650 aa  452  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  39.82 
 
 
685 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
719 aa  435  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
687 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
653 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
733 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  53.23 
 
 
601 aa  416  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  35.05 
 
 
667 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  37.68 
 
 
692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  35.05 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  35.05 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
652 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
673 aa  409  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.72 
 
 
639 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
878 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.28 
 
 
766 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  34.32 
 
 
667 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
690 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  38.79 
 
 
910 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
686 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
701 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  48.3 
 
 
681 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.61 
 
 
801 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
675 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
935 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
688 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
728 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
937 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
691 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
696 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  49.26 
 
 
954 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 
921 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 
715 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
796 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  48.49 
 
 
677 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
747 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
671 aa  376  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
747 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
729 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 
739 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.59 
 
 
655 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
934 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.93 
 
 
715 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
745 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  35.95 
 
 
669 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  35.05 
 
 
888 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  36.15 
 
 
625 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 
737 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 
743 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.77 
 
 
942 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  35.95 
 
 
669 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  35.95 
 
 
669 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.6 
 
 
674 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  35.95 
 
 
669 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  42.23 
 
 
736 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
1031 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  36.46 
 
 
654 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
654 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
686 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.46 
 
 
681 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.84 
 
 
669 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.44 
 
 
662 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
654 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 
669 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 
654 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.86 
 
 
767 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  36.02 
 
 
934 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  36.94 
 
 
922 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  36.46 
 
 
654 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
911 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  40.35 
 
 
754 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
691 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 
654 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
713 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.31 
 
 
734 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  47.1 
 
 
748 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
759 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  36.62 
 
 
652 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
709 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
747 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  49.22 
 
 
1089 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 
652 aa  366  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  42.48 
 
 
744 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  36.31 
 
 
654 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  40.46 
 
 
751 aa  366  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  47.57 
 
 
753 aa  366  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>