More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0187 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 		 344 aa  675    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  86.63 
 
 		 345 aa  597  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  85.47 
 
 		 345 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  85.51 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  85.51 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  86.05 
 
 		 345 aa  589  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  85.17 
 
 		 345 aa  586  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  85.22 
 
 		 346 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  81.63 
 
 		 343 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  79.47 
 
 		 345 aa  551  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.11 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  61.22 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  60.7 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  58.94 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  58.89 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  58.89 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  58.89 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.06 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  58.53 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  58.06 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 		 343 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  57.48 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  57.74 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  59.06 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  55.82 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  56.43 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  58.88 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  56.43 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  54.97 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  54.93 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  56.72 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  56.64 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.69 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  56.64 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  54.33 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  54.95 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  56.64 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  56.05 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.06 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  56.64 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  56.34 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  53.91 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  55.46 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.6 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  55.92 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  55.2 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  57.77 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  54.94 
 
 		 348 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  57.93 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>