More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0123 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
321 aa  649    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.8 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.48 
 
 
320 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.48 
 
 
320 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.48 
 
 
320 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  41.02 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  39.74 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  40.75 
 
 
320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
337 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.33 
 
 
334 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
337 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1386  amino acid ABC transporter permease  37.8 
 
 
337 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693888  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0446  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  45.54 
 
 
264 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3071  amino acid ABC transporter permease  41.58 
 
 
309 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  44.06 
 
 
230 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  42.21 
 
 
265 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
269 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05951  ABC transporter ATP-binding/permease protein  42.21 
 
 
265 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
261 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1931  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 
272 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2288  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 
278 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.46 
 
 
222 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
216 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
216 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.87 
 
 
492 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0203  amino acid ABC transporter, permease protein  42.49 
 
 
265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.06 
 
 
216 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.07 
 
 
216 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  40.69 
 
 
234 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2686  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.55 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0551964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
263 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  42.57 
 
 
269 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  40.81 
 
 
291 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  40.81 
 
 
269 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
268 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  42.03 
 
 
222 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
263 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.820023 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 
485 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 
485 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
494 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
233 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  43 
 
 
242 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.99 
 
 
493 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  40.26 
 
 
501 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.95 
 
 
221 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.2 
 
 
219 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
219 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0219509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.89 
 
 
230 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.61 
 
 
267 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.755534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  41 
 
 
219 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0347  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.02 
 
 
230 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3795  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
262 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1071  hypothetical protein  42.58 
 
 
235 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  42.78 
 
 
216 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  41 
 
 
485 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39 
 
 
219 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0815  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
246 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal  0.0721562 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
227 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.5 
 
 
219 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
222 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4224  amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
219 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000683545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
266 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0283053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4284  amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
219 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000456924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4058  amino acid ABC transporter permease  42.16 
 
 
219 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3897  amino acid ABC transporter, permease  42.16 
 
 
219 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.09435e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3904  amino acid ABC transporter, permease  42.16 
 
 
219 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000728027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
219 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0526601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  39.52 
 
 
251 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
219 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.126592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4375  amino acid ABC transporter permease  42.16 
 
 
219 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000115102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4263  amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
219 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00620505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  39.5 
 
 
223 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0972  amino acid ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
219 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000627476  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  39.7 
 
 
219 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
218 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 
271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2307  amino acid ABC transporter permease  35.27 
 
 
261 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000136717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
221 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 
513 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
219 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
215 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2970  amino acid ABC transporter permease  40.1 
 
 
217 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 
217 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0467  amino acid ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
290 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
219 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  39.5 
 
 
219 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  41.97 
 
 
217 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  39.5 
 
 
219 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  39.5 
 
 
219 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1825  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 
262 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120265  normal  0.903781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>