More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0120 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  39.91 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  36.74 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  42.33 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  42.73 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  40.91 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  43.18 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  40.18 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  43.32 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  33.94 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  41.79 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  36.11 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  35.35 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.57 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  30.91 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  32.57 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.13 
 
 		 239 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  31.08 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  31.96 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5173  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4744  response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4763  response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5179  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5275  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5188  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5144  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0071  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.32 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.73 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  33.03 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3110  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  30.28 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  33.03 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.82 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  30.67 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4900  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  31.08 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  32.11 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.19 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>