More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0106 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2081  response regulator receiver  42.06 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0827  response regulator receiver domain-containing protein  39.72 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.914575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1440  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.42 
 
 		 425 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 476 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  43.65 
 
 		 566 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  39.5 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0280  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 450 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  37.88 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  38.66 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  37.29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.46 
 
 		 616 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  38.89 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 487 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 564 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 304 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0569  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 129 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.04 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 547 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.5 
 
 		 953 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  31.54 
 
 		 564 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.56 
 
 		 953 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.14 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0987  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  30.43 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  36.59 
 
 		 1347 aa  71.6  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  33.62 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 1180 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  29.14 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.52 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1152  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  37.07 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0616  DNA-binding response regulator VncR  29.73 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  29.13 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  31.3 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2355  two component Fis family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  31.25 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.77 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2077  vncR, response regulator  29.35 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00119329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 636 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 357 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 508 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  36.52 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3153  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.34 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.97 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  33.63 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.06 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1151  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  28.48 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  31.53 
 
 		 1278 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  38.53 
 
 		 127 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  28.03 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 456 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  33.07 
 
 		 1370 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  24.22 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>