More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0097 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  100 
 
 
222 aa  452  1e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 
219 aa  210  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
220 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  5.47046e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  45.66 
 
 
220 aa  200  2e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  45.09 
 
 
228 aa  190  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  47.06 
 
 
221 aa  188  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  43.18 
 
 
222 aa  185  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
218 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  41.55 
 
 
220 aa  175  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  46.82 
 
 
220 aa  171  6e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  45.23 
 
 
221 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  45.23 
 
 
221 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  1.88808e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  45.23 
 
 
221 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  40.91 
 
 
221 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  39.35 
 
 
219 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 
217 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 
220 aa  145  4e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  34.1 
 
 
223 aa  144  8e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 
223 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 
220 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 
217 aa  142  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
217 aa  141  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 
222 aa  140  2e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 
230 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  35 
 
 
221 aa  139  4e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  32.72 
 
 
220 aa  138  8e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 
260 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.31 
 
 
219 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  31.63 
 
 
219 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  34.55 
 
 
221 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 
221 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  31.8 
 
 
229 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 
219 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.81553e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  32.26 
 
 
223 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 
226 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.42937e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 
220 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  28.9 
 
 
220 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  31.02 
 
 
227 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 
224 aa  136  3e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  31.02 
 
 
227 aa  135  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  32.26 
 
 
223 aa  135  3e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  31.63 
 
 
227 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  33.04 
 
 
236 aa  135  7e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  31.34 
 
 
220 aa  135  7e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.70917e-05  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 
219 aa  135  7e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
247 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
247 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 
236 aa  134  1e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  34.56 
 
 
225 aa  134  1e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 
266 aa  134  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  134  1e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 
246 aa  133  2e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
250 aa  134  2e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 
224 aa  134  2e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
247 aa  133  2e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 
226 aa  133  2e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  34.07 
 
 
223 aa  134  2e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 
223 aa  133  2e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
247 aa  133  2e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 
228 aa  133  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  34.42 
 
 
220 aa  133  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 
224 aa  133  2e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.08 
 
 
226 aa  133  2e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 
220 aa  134  2e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
247 aa  133  2e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 
220 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  33.95 
 
 
225 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 
225 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 
221 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 
235 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 
253 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 
236 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  31.63 
 
 
221 aa  132  4e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 
252 aa  132  4e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 
244 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  30.88 
 
 
291 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.57 
 
 
223 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  30.88 
 
 
223 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  33.79 
 
 
226 aa  131  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 
224 aa  131  7e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 
224 aa  131  8e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  30.41 
 
 
223 aa  131  8e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 
224 aa  131  8e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2735  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
226 aa  131  8e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.089268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  32.27 
 
 
220 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  30.56 
 
 
227 aa  130  1e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 
224 aa  131  1e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  29.36 
 
 
221 aa  130  1e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  31.67 
 
 
224 aa  131  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.95 
 
 
220 aa  130  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.02279e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  31.34 
 
 
221 aa  130  2e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 
236 aa  130  2e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.95 
 
 
220 aa  130  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 
225 aa  130  2e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 
242 aa  130  2e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 
220 aa  130  2e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 
237 aa  130  2e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  29.77 
 
 
225 aa  130  2e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.95 
 
 
220 aa  130  2e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.64215e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>