More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0096 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
395 aa  788  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  38.61 
 
 
371 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  39.92 
 
 
353 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  2.22357e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  39.92 
 
 
396 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  41.74 
 
 
407 aa  189  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  33.07 
 
 
389 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  32.62 
 
 
435 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  40 
 
 
375 aa  173  4e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  36.12 
 
 
388 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  34.03 
 
 
331 aa  166  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  36.61 
 
 
389 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  35.17 
 
 
388 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  30.15 
 
 
374 aa  142  2e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  28 
 
 
372 aa  135  2e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  29.36 
 
 
393 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  28.07 
 
 
368 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  34.72 
 
 
379 aa  121  2e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  32.77 
 
 
281 aa  120  4e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  31.48 
 
 
497 aa  109  9e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  32.18 
 
 
629 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  27.71 
 
 
427 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  28.63 
 
 
290 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
419 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  27.8 
 
 
439 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0037  histidine kinase  24.42 
 
 
303 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  28.64 
 
 
256 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
436 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
452 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
500 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  27.91 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  27.27 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  27.27 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  30.81 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
569 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  31.13 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
445 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  28.26 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
624 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
453 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  32.41 
 
 
337 aa  97.1  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  7.36417e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
457 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  30 
 
 
448 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  27.21 
 
 
436 aa  96.3  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  26.38 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
606 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  31.31 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
603 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
466 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  26.82 
 
 
952 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
610 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
610 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  27.21 
 
 
610 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
1043 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  24.81 
 
 
443 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.16217e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.88 
 
 
490 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  2.98579e-06  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3217  Cache sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
699 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
699 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508028  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
589 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.11549e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  28.38 
 
 
835 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.52 
 
 
423 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  27.09 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1808 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
495 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  27.76 
 
 
443 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1331 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
466 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
769 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  32.42 
 
 
466 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  32.42 
 
 
466 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  27.76 
 
 
457 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  26.48 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
631 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
469 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
504 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  28.31 
 
 
492 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
772 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
439 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
476 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  31.13 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
678 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  30.66 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.42 
 
 
466 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  26.24 
 
 
1014 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  26.24 
 
 
988 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
453 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  26.24 
 
 
1032 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  26.42 
 
 
474 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
459 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>