228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0092 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0092  protein of unknown function DUF520  100 
 
 
165 aa  327  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  51.52 
 
 
165 aa  172  2e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  50.3 
 
 
165 aa  170  7e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1664  putative nucleotide-binding protein  52.12 
 
 
165 aa  165  3e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0039  putative nucleotide-binding protein  49.09 
 
 
165 aa  160  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0398  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
163 aa  151  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.167613  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1583  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
163 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0423  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
163 aa  150  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1551  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
163 aa  150  9e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  48.48 
 
 
166 aa  137  9e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  43.64 
 
 
164 aa  134  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  44.24 
 
 
165 aa  129  1e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.72661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  125  4e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  124  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  4.70515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
162 aa  119  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  119  2e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  37.58 
 
 
165 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
160 aa  117  8e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  117  1e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  116  1e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  3.04548e-06 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
163 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
160 aa  114  7e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  39.38 
 
 
161 aa  114  7e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  39.38 
 
 
161 aa  114  7e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 
161 aa  113  1e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  113  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  5.36011e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  112  2e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  112  2e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  112  2e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
162 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  41.57 
 
 
163 aa  109  1e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  109  1e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40.12 
 
 
161 aa  109  1e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
159 aa  109  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  109  2e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
159 aa  108  2e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  109  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
162 aa  109  2e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  109  2e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  39.38 
 
 
163 aa  108  2e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  108  4e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
159 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
162 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
164 aa  107  7e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  39.51 
 
 
164 aa  107  7e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
159 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  37.58 
 
 
165 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  1.73634e-08 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  42.24 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  41.25 
 
 
161 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  104  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
159 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  37.13 
 
 
165 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  35.76 
 
 
165 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  38.32 
 
 
163 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.20146e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  37.27 
 
 
164 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>