More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0082 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
171 aa  346  8e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.96209e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1701  translation initiation factor IF-3  74.85 
 
 
172 aa  249  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00889873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0029  translation initiation factor IF-3  73.68 
 
 
173 aa  246  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0200  translation initiation factor IF-3  73.68 
 
 
172 aa  243  6e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0239  translation initiation factor IF-3  73.68 
 
 
172 aa  243  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  70.76 
 
 
172 aa  243  7e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  3.59846e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0217  translation initiation factor IF-3  73.68 
 
 
172 aa  243  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1818  translation initiation factor IF-3  73.17 
 
 
165 aa  236  8e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  65.12 
 
 
172 aa  232  2e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  1.01132e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0612  translation initiation factor IF-3  67.44 
 
 
173 aa  210  8e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
172 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.34184e-28 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  53.33 
 
 
207 aa  168  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 
190 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.48528e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  45.88 
 
 
195 aa  165  3e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.17232e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  45.88 
 
 
195 aa  165  3e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.45665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  45.88 
 
 
186 aa  165  3e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  6.90292e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  45.88 
 
 
195 aa  165  3e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.20658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  45.88 
 
 
195 aa  165  3e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.32272e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 
172 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 
173 aa  164  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
166 aa  163  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.2216e-07  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
166 aa  163  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.01645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
166 aa  163  1e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
166 aa  163  1e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.60309e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.5 
 
 
202 aa  163  1e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  45.29 
 
 
195 aa  162  2e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.25648e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
166 aa  162  2e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.11711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.61 
 
 
164 aa  162  2e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.14962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  47.95 
 
 
173 aa  160  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 
238 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 
198 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.35112e-07  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 
252 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 
219 aa  158  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  50.93 
 
 
197 aa  156  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  47.53 
 
 
179 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.47 
 
 
171 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  46.78 
 
 
187 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 
225 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 
176 aa  154  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  48.73 
 
 
194 aa  153  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 
177 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
193 aa  152  3e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.92532e-08  hitchhiker  5.79185e-07 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 
164 aa  152  3e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.44552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  46.63 
 
 
170 aa  151  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.56408e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  43.56 
 
 
178 aa  150  9e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 
169 aa  150  9e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 
190 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  45.61 
 
 
173 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  47.31 
 
 
198 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
192 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 
177 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 
171 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.44125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 
194 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
174 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 
164 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 
179 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 
164 aa  147  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.72838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
176 aa  147  1e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  7.20798e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 
204 aa  146  1e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 
181 aa  146  1e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 
202 aa  146  1e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
173 aa  145  2e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 
194 aa  145  2e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 
173 aa  145  2e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 
194 aa  145  2e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.44 
 
 
154 aa  146  2e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20038e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 
357 aa  145  2e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 
173 aa  145  2e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 
178 aa  146  2e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  43.93 
 
 
175 aa  145  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.87486e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 
227 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 
174 aa  144  4e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  40 
 
 
173 aa  144  4e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 
186 aa  144  4e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl188  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 
180 aa  145  4e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.75747e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  46.41 
 
 
165 aa  144  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 
159 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 
154 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
175 aa  144  8e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 
180 aa  144  8e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
176 aa  144  8e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
176 aa  144  8e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 
277 aa  144  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
178 aa  143  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 
233 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
205 aa  144  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 
178 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
184 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 
178 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  46.62 
 
 
154 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  8.64988e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 
171 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  44.72 
 
 
182 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.97976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 
204 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  41.57 
 
 
176 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>