More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0081 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
636 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
605 aa  1252    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  73.55 
 
 
602 aa  936    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  73.22 
 
 
602 aa  935    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
646 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  74.88 
 
 
603 aa  948    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
636 aa  661    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
636 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  72.16 
 
 
606 aa  940    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
645 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 
602 aa  838    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  73.93 
 
 
609 aa  951    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  72.65 
 
 
606 aa  937    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
645 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  73.22 
 
 
602 aa  927    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1702  threonyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
617 aa  904    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000310236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
636 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 
638 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
644 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
644 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
649 aa  622  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
644 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
644 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
644 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
635 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
643 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
637 aa  597  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
647 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
638 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
637 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
639 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
639 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
639 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
639 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
635 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
644 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
644 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
643 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
640 aa  569  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
635 aa  568  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
637 aa  568  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
638 aa  566  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
635 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
636 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
638 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  49.56 
 
 
582 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
634 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
640 aa  554  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
582 aa  553  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
648 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
633 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
639 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
637 aa  549  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
582 aa  548  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
588 aa  546  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
634 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
642 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
634 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
635 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
635 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
638 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
635 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
640 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
635 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
635 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
646 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
662 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
637 aa  535  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
635 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
640 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
635 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
637 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
635 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
635 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
633 aa  538  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
635 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
640 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
635 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
637 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
635 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
636 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
635 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
635 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
635 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
635 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
635 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>