265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0076 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  100 
 
 
562 aa  1150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  33.69 
 
 
564 aa  348  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 
583 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  32.83 
 
 
614 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  33.39 
 
 
563 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 
564 aa  307  4e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 
546 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  30.98 
 
 
575 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  30.6 
 
 
579 aa  284  3e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  27.77 
 
 
564 aa  283  4e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  31.55 
 
 
607 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.42956e-05  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  24.64 
 
 
650 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.32 
 
 
347 aa  84  7e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 
355 aa  82.8  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.39 
 
 
332 aa  82.8  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.44 
 
 
330 aa  81.3  4e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.04 
 
 
350 aa  79.3  2e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.04 
 
 
350 aa  79.3  2e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.51 
 
 
333 aa  78.6  3e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 
325 aa  77.4  7e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.31 
 
 
350 aa  75.1  3e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 
337 aa  75.1  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  31.41 
 
 
352 aa  73.9  6e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 
397 aa  73.9  7e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.21375e-05  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.97 
 
 
330 aa  73.9  7e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  23.38 
 
 
335 aa  72.8  1e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  24.32 
 
 
366 aa  72.8  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 
346 aa  72.4  2e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.68 
 
 
334 aa  72.4  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.68 
 
 
334 aa  72.4  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.2 
 
 
351 aa  72.4  2e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 
339 aa  72  3e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  24.66 
 
 
384 aa  72  3e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.9 
 
 
350 aa  71.6  3e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.68 
 
 
330 aa  72  3e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.11 
 
 
330 aa  71.6  4e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 
330 aa  71.2  5e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  27.03 
 
 
351 aa  69.3  2e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.56 
 
 
341 aa  69.3  2e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.17 
 
 
351 aa  68.9  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.5 
 
 
371 aa  68.9  2e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.13 
 
 
351 aa  68.2  3e-10  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.13 
 
 
351 aa  68.6  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.13 
 
 
351 aa  68.6  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.77 
 
 
352 aa  68.2  4e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  22.31 
 
 
337 aa  67.4  7e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  23.75 
 
 
350 aa  65.9  2e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 
347 aa  65.1  4e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  21.13 
 
 
542 aa  63.9  7e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.89 
 
 
354 aa  63.5  9e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.65 
 
 
346 aa  63.5  9e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  22.8 
 
 
355 aa  62.8  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.45 
 
 
338 aa  62.8  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 
350 aa  61.2  5e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.37 
 
 
335 aa  61.2  5e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 
335 aa  60.8  6e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25.42 
 
 
324 aa  60.8  7e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.51 
 
 
336 aa  60.8  7e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  23.98 
 
 
399 aa  60.5  8e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 
388 aa  60.5  8e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 
332 aa  59.7  1e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  24.79 
 
 
335 aa  60.1  1e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.41 
 
 
335 aa  59.7  1e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  30.51 
 
 
531 aa  59.3  2e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.81 
 
 
359 aa  58.9  2e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  35.37 
 
 
229 aa  57.8  5e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  27.41 
 
 
606 aa  57.8  5e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  20.85 
 
 
357 aa  57.8  6e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.52 
 
 
345 aa  57.4  7e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  23.9 
 
 
346 aa  57  8e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  29.45 
 
 
225 aa  57  8e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.17 
 
 
351 aa  57  9e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  28.21 
 
 
341 aa  57  9e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  22.56 
 
 
352 aa  56.6  1e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.39 
 
 
332 aa  56.6  1e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  22.19 
 
 
346 aa  56.6  1e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.31 
 
 
346 aa  56.6  1e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  36.46 
 
 
561 aa  55.8  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  26.43 
 
 
395 aa  55.5  3e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 
362 aa  55.5  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 
682 aa  55.1  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.67 
 
 
654 aa  55.5  3e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 
567 aa  55.5  3e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  21.89 
 
 
393 aa  55.5  3e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  26.49 
 
 
568 aa  54.7  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  22.84 
 
 
337 aa  54.7  4e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 
228 aa  54.7  4e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  21.37 
 
 
661 aa  54.3  5e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  21.37 
 
 
661 aa  54.3  5e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  29.29 
 
 
218 aa  54.3  6e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  23.89 
 
 
356 aa  54.3  6e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  30.69 
 
 
565 aa  54.3  6e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  25.95 
 
 
568 aa  54.3  6e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 
666 aa  53.9  7e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  24.26 
 
 
256 aa  53.9  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.23 
 
 
356 aa  53.5  9e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  23.11 
 
 
395 aa  53.5  9e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 
639 aa  53.1  1e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  21.77 
 
 
341 aa  53.5  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 
573 aa  52.8  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>