283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0075 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  76.74 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  71.26 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  67.82 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  65.52 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  65.52 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  65.52 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  48.35 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  45.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  43.21 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  42.53 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  46.58 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  36.71 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.58 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>