More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0074 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  723    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  72.11 
 
 		 355 aa  544  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  70.7 
 
 		 355 aa  534  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  74.37 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  73.52 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  73.24 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  73.52 
 
 		 355 aa  529  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  72.96 
 
 		 355 aa  519  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  68.56 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  66.2 
 
 		 355 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  60.29 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  60.88 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  55.14 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  59.7 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  59.7 
 
 		 359 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.96 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.36 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 357 aa  384  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  55.52 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  58.53 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.59 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  55.94 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 355 aa  374  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.39 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  56.1 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.68 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  55.36 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  55.36 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  52.75 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  55.36 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2460  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00177456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2179  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0912707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>