75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0073 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  44.95 
 
 
223 aa  197  1e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  43.78 
 
 
235 aa  195  5e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  3.59095e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.7 
 
 
243 aa  181  9e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.59 
 
 
244 aa  181  9e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.7 
 
 
243 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  39.15 
 
 
270 aa  146  2e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  5.56975e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.15 
 
 
270 aa  146  2e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  39.15 
 
 
270 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  40.19 
 
 
255 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  39.45 
 
 
310 aa  140  2e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  36.49 
 
 
270 aa  140  2e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  36.32 
 
 
270 aa  140  2e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.11011e-06  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  36.49 
 
 
270 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  36.49 
 
 
270 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  36.49 
 
 
270 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  36.06 
 
 
294 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  37.61 
 
 
330 aa  135  6e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  34.91 
 
 
288 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  35.25 
 
 
250 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.1 
 
 
272 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  36.7 
 
 
267 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  35.51 
 
 
270 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  36.65 
 
 
275 aa  127  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  35.29 
 
 
275 aa  127  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3158e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  35.91 
 
 
290 aa  126  2e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  34.39 
 
 
275 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  34.7 
 
 
259 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  34.8 
 
 
290 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  38.81 
 
 
309 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  35.5 
 
 
278 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  45.59 
 
 
354 aa  116  2e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  37.68 
 
 
353 aa  116  2e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.07 
 
 
320 aa  117  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  35.85 
 
 
301 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  36.41 
 
 
342 aa  114  2e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  36.41 
 
 
297 aa  113  2e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  31.33 
 
 
237 aa  112  7e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  42.42 
 
 
245 aa  110  2e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  30.99 
 
 
293 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.29 
 
 
286 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  32.49 
 
 
257 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.56 
 
 
293 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  30.88 
 
 
278 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  29.11 
 
 
307 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  81.3  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.7  3e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.7  4e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.3 
 
 
274 aa  79.7  4e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.7  4e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.7  4e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.7  4e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.7  4e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  28.3 
 
 
274 aa  79.3  5e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  29.19 
 
 
322 aa  76.6  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  33.58 
 
 
174 aa  73.9  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  32.2 
 
 
307 aa  69.7  4e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  34.78 
 
 
302 aa  67.8  1e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  57.8  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  59.46 
 
 
202 aa  49.7  4e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  30.99 
 
 
390 aa  50.1  4e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2771  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  70 
 
 
307 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1812  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  63.33 
 
 
197 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0555239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.92 
 
 
74 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.52 
 
 
568 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.6221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  32.98 
 
 
379 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1782  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  53.85 
 
 
300 aa  42.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.58 
 
 
325 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.4 
 
 
317 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.08 
 
 
308 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>