More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0070 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0070  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
331 aa  671  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2050  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.09 
 
 
331 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.402206  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.94 
 
 
327 aa  442  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.39 
 
 
327 aa  438  1e-122  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1700  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.6 
 
 
329 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1514  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.91 
 
 
329 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1774  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.84 
 
 
327 aa  431  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0052  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.09 
 
 
329 aa  430  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00129259  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1881  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.98 
 
 
329 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0109  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.39 
 
 
327 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.12 
 
 
352 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.27 
 
 
345 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.96 
 
 
345 aa  345  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.93 
 
 
352 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.76 
 
 
345 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.52 
 
 
359 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.13 
 
 
345 aa  337  1e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.81532e-06  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.82 
 
 
352 aa  337  2e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.58 
 
 
358 aa  337  2e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.78 
 
 
336 aa  337  2e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.04 
 
 
351 aa  336  3e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
352 aa  335  6e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.85 
 
 
345 aa  335  6e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
352 aa  335  6e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
352 aa  335  6e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
352 aa  335  6e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.24 
 
 
359 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.24 
 
 
359 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.87 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  4.74517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.21 
 
 
345 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
352 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.52 
 
 
345 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.23 
 
 
345 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.99 
 
 
363 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.4 
 
 
348 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.91 
 
 
352 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.34 
 
 
345 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.22816e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.05 
 
 
346 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.1 
 
 
348 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.16 
 
 
347 aa  329  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.5 
 
 
346 aa  329  5e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.89 
 
 
345 aa  328  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.31 
 
 
345 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.12 
 
 
353 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.72 
 
 
345 aa  328  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.46 
 
 
345 aa  328  1e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.91 
 
 
346 aa  328  1e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.94 
 
 
347 aa  327  1e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.12 
 
 
410 aa  327  1e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.66 
 
 
346 aa  328  1e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.46 
 
 
345 aa  328  1e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.55661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.46 
 
 
345 aa  328  1e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.37 
 
 
357 aa  327  2e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.82 
 
 
345 aa  327  2e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.22973e-05  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
348 aa  327  2e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.54 
 
 
349 aa  327  2e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.52 
 
 
346 aa  327  2e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
350 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.04477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.19 
 
 
352 aa  326  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.21 
 
 
363 aa  325  4e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
350 aa  326  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
350 aa  326  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  326  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.25 
 
 
349 aa  326  4e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  326  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  326  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.61 
 
 
347 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
345 aa  325  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.61 
 
 
347 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.90358e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.96 
 
 
379 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.37 
 
 
357 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  2.31938e-10 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.44 
 
 
369 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  9.80143e-08 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.08 
 
 
346 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.5 
 
 
345 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.49 
 
 
340 aa  322  7e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.97 
 
 
358 aa  321  9e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.52 
 
 
345 aa  321  9e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.77 
 
 
348 aa  321  1e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.53 
 
 
355 aa  321  1e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
349 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.4 
 
 
348 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.38623e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.11 
 
 
357 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.76 
 
 
346 aa  315  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.33 
 
 
345 aa  315  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.48 
 
 
346 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.55 
 
 
353 aa  314  2e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.97 
 
 
355 aa  313  2e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.96 
 
 
349 aa  313  3e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.99 
 
 
346 aa  311  7e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>