More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0064 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
321 aa  644  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  67.3 
 
 
320 aa  435  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  64.69 
 
 
317 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  63.75 
 
 
320 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  61.98 
 
 
319 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1810  KpsF/GutQ  61.64 
 
 
326 aa  374  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220338  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 
318 aa  304  1e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  52.88 
 
 
315 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  52.88 
 
 
315 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  52.76 
 
 
315 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.42 
 
 
321 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47451e-08 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  46.18 
 
 
315 aa  286  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  49.19 
 
 
342 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  45.11 
 
 
329 aa  277  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.64449e-05  hitchhiker  8.29793e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 
322 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 
321 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 
321 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 
321 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  46.86 
 
 
322 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  44.41 
 
 
330 aa  275  1e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  44.94 
 
 
320 aa  273  4e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  44.1 
 
 
330 aa  269  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  42.27 
 
 
331 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  45.11 
 
 
326 aa  268  6e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  44.38 
 
 
339 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 
322 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  43.12 
 
 
323 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  43.65 
 
 
310 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  43.3 
 
 
334 aa  265  9e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  41.32 
 
 
333 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  40.13 
 
 
320 aa  261  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  40.13 
 
 
320 aa  261  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  44.1 
 
 
321 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  45.43 
 
 
333 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  43.04 
 
 
321 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  43.99 
 
 
333 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  44.69 
 
 
323 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  43.57 
 
 
321 aa  258  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  44.06 
 
 
326 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.89 
 
 
328 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 
332 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  41.88 
 
 
324 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  41.88 
 
 
324 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 
323 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  44.55 
 
 
326 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  41.01 
 
 
340 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  42.04 
 
 
331 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 
328 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
342 aa  255  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 
321 aa  255  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  42.35 
 
 
310 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
357 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 
328 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 
328 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
328 aa  255  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 
328 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.99 
 
 
330 aa  254  1e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  45.25 
 
 
345 aa  254  1e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  41.88 
 
 
332 aa  254  1e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  6.13072e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  45.25 
 
 
345 aa  254  1e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  42.99 
 
 
311 aa  254  1e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45.98 
 
 
324 aa  254  1e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 
328 aa  254  2e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  44.97 
 
 
335 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  43.71 
 
 
319 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.61 
 
 
328 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 
328 aa  253  4e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  42.45 
 
 
328 aa  253  5e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.07 
 
 
328 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  44.01 
 
 
317 aa  252  8e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  40.75 
 
 
320 aa  251  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  44.2 
 
 
326 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  40.82 
 
 
327 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  44.19 
 
 
324 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.24 
 
 
328 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  44.19 
 
 
324 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  44.3 
 
 
329 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  41.21 
 
 
326 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.07 
 
 
328 aa  248  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  42.04 
 
 
357 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  42.9 
 
 
325 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  44.19 
 
 
324 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  45.6 
 
 
338 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.52 
 
 
344 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  43.08 
 
 
330 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  44.38 
 
 
321 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  41.74 
 
 
330 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 
331 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  41.9 
 
 
333 aa  246  5e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  42.31 
 
 
319 aa  246  5e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  43.03 
 
 
329 aa  246  5e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  43.26 
 
 
324 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  43.49 
 
 
333 aa  245  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>