More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0057 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0057  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1535  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.43 
 
 
203 aa  234  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0341155  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0233  hypothetical protein  50.74 
 
 
204 aa  225  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001438  2-keto-4-pentenoate hydratase  50 
 
 
204 aa  221  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.301342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06282  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  51.23 
 
 
204 aa  219  2e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1402  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50 
 
 
204 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1387  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.4 
 
 
208 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2723  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.72 
 
 
203 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2951  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.43 
 
 
208 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.747988  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.38 
 
 
203 aa  216  3e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal  0.0120347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.15 
 
 
208 aa  214  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  51.2 
 
 
208 aa  213  1e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1190  putative fumarylacetoacetate hydrolase  48.77 
 
 
204 aa  213  2e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.43938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1426  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.87 
 
 
208 aa  211  5e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.768484  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1403  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.87 
 
 
208 aa  211  5e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2637  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.21 
 
 
223 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1093  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.57 
 
 
202 aa  203  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0702  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  49.47 
 
 
217 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2857  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.07 
 
 
208 aa  194  8e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2689  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.07 
 
 
208 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.490642  normal  0.0512054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2757  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.51 
 
 
208 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.530786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1216  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.29 
 
 
230 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4850  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.78 
 
 
221 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0330  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.54 
 
 
238 aa  140  1e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0299  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.1 
 
 
238 aa  139  2e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5292  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.33 
 
 
221 aa  140  2e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2939  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.31 
 
 
203 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2800  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.16 
 
 
219 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13578  putative hydrolase  38.42 
 
 
204 aa  135  3e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3591  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  40.21 
 
 
218 aa  134  7e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.22928e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.29 
 
 
212 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202477  normal  0.468073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0312  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.68 
 
 
221 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48300  Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  41.27 
 
 
233 aa  134  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.54 
 
 
218 aa  133  2e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04150  hypothetical protein  40.31 
 
 
221 aa  130  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0411  hypothetical protein  38.78 
 
 
221 aa  129  2e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0650  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.31 
 
 
218 aa  130  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4986  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.5 
 
 
203 aa  130  2e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3666  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  39.79 
 
 
218 aa  130  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5385  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.82 
 
 
221 aa  130  2e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0663  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  37.17 
 
 
218 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8086e-26 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0543  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.21 
 
 
225 aa  129  4e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0262694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4230  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.42 
 
 
232 aa  127  2e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5206  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.04 
 
 
221 aa  125  4e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640418  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2937  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.31 
 
 
218 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18618e-13 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5060  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.04 
 
 
221 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2815  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.89 
 
 
220 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1185  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  38.95 
 
 
219 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5153  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.51 
 
 
221 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479206  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1891  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  38.62 
 
 
203 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0882  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.45 
 
 
203 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2369  hypothetical protein  36.51 
 
 
219 aa  121  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.73957e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1536  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.84 
 
 
203 aa  120  1e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01142  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  32.66 
 
 
222 aa  119  2e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2468  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  36.32 
 
 
219 aa  119  2e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2238  hypothetical protein  38.71 
 
 
218 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  3.04661e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2118  hypothetical protein  37.1 
 
 
218 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0891763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2007  hypothetical protein  37.1 
 
 
218 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0101882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2395  hypothetical protein  37.1 
 
 
218 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0911799  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01165  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1666  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.38137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1280  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.9251e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01155  predicted isomerase/hydrolase  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2445  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1942  hypothetical protein  38.71 
 
 
218 aa  119  4e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.5991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1324  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.69423e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1335  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  119  4e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00641682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1969  hypothetical protein  36.32 
 
 
219 aa  118  8e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000105527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.89 
 
 
205 aa  117  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1999  hypothetical protein  37.1 
 
 
218 aa  117  2e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00012789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2004  hypothetical protein  36.56 
 
 
218 aa  115  4e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.394178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0603  FAA hydrolase family protein  36.13 
 
 
217 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.90593e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2376  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.36 
 
 
231 aa  112  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.127733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1114  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  33.33 
 
 
219 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1996  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.26 
 
 
214 aa  111  8e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2106  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.51 
 
 
203 aa  110  1e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1505  hypothetical protein  34.34 
 
 
219 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2011  hypothetical protein  34.34 
 
 
219 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.517468  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1951  hypothetical protein  34.34 
 
 
219 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2753  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  110  1e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.67242e-10  hitchhiker  0.000114559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1954  hypothetical protein  34.34 
 
 
219 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1321  hypothetical protein  34.92 
 
 
219 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.14215e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2527  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  36.36 
 
 
258 aa  110  2e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1039  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.31 
 
 
239 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1692  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.9 
 
 
228 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80437  fumarylacetoacetate hydralase  33.68 
 
 
231 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0346038  normal  0.482803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3195  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.2 
 
 
238 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.48446  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2706  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.52 
 
 
231 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0782  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  34.41 
 
 
245 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2264  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  34.76 
 
 
258 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47029e-10 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2289  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  35.48 
 
 
245 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1084  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  33.51 
 
 
254 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.83764e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0073  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.29 
 
 
229 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1531  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  33.33 
 
 
202 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1345  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.41 
 
 
247 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.411511  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0062  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  31.77 
 
 
229 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0063  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  31.77 
 
 
229 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1170  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.42 
 
 
228 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0072  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.8 
 
 
225 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.620736  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2538  hypothetical protein  33.51 
 
 
228 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.570188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>