244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0052 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0052  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  100 
 
 
701 aa  1471  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.46 
 
 
627 aa  705  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4058  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.59 
 
 
707 aa  1070  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
583 aa  734  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2742  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
583 aa  734  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2685  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
583 aa  734  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
587 aa  734  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2383  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
583 aa  734  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0087  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.09 
 
 
678 aa  743  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2989  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56 
 
 
581 aa  709  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.935687  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0021  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  70.25 
 
 
689 aa  1037  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39690  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.46 
 
 
675 aa  785  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192369  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.27 
 
 
629 aa  710  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5139  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.17 
 
 
574 aa  729  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3517  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.93 
 
 
673 aa  772  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0368  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.21 
 
 
675 aa  759  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3365  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.6 
 
 
675 aa  778  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172417  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  72.06 
 
 
893 aa  1006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.89 
 
 
701 aa  1107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.07 
 
 
636 aa  722  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.03 
 
 
683 aa  763  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1782  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.92 
 
 
687 aa  767  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.309606  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.38 
 
 
695 aa  640  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.67 
 
 
675 aa  767  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.67 
 
 
591 aa  729  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.529352  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2340  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.67 
 
 
591 aa  729  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855235  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2642  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.66 
 
 
673 aa  766  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1779  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.31 
 
 
669 aa  771  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0307976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0454  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.14 
 
 
703 aa  1083  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000238531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.92 
 
 
687 aa  768  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4657  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.03 
 
 
683 aa  763  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.68774  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0862  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  70.66 
 
 
698 aa  1054  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.22 
 
 
692 aa  647  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1897  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.74 
 
 
700 aa  1104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000617448  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57 
 
 
596 aa  737  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
583 aa  734  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0963  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.87 
 
 
683 aa  763  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.83 
 
 
583 aa  734  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00137002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1276  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.97 
 
 
673 aa  768  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  58.95 
 
 
608 aa  751  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  1.87982e-05 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1331  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.87 
 
 
708 aa  648  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0843156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1239  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  79.94 
 
 
698 aa  1182  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2171  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.71 
 
 
676 aa  758  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00664522  hitchhiker  0.00155539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.08 
 
 
676 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.177908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.78 
 
 
800 aa  621  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.1031e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.54 
 
 
690 aa  613  1e-174  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.62 
 
 
813 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.03 
 
 
816 aa  608  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.57 
 
 
718 aa  601  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.37 
 
 
730 aa  598  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.05 
 
 
721 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.34 
 
 
630 aa  583  1e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.98 
 
 
706 aa  585  1e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.16 
 
 
705 aa  583  1e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.21 
 
 
710 aa  584  1e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.31 
 
 
709 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.87 
 
 
696 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.86 
 
 
719 aa  577  1e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.24 
 
 
697 aa  575  1e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.09 
 
 
730 aa  573  1e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.51 
 
 
715 aa  573  1e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.68 
 
 
686 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.67 
 
 
695 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.59 
 
 
638 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.47 
 
 
681 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.27 
 
 
685 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.32 
 
 
704 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.1 
 
 
627 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.67 
 
 
689 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  47.54 
 
 
623 aa  545  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.9 
 
 
636 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0922  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.17 
 
 
603 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0018873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.53 
 
 
639 aa  274  5e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1315  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  29.56 
 
 
665 aa  251  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.79 
 
 
606 aa  237  6e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.79 
 
 
606 aa  235  2e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  28.12 
 
 
604 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.31 
 
 
709 aa  199  1e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.79 
 
 
791 aa  184  5e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.79 
 
 
791 aa  184  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.46 
 
 
791 aa  182  3e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.08 
 
 
768 aa  178  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.75 
 
 
794 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  26.74 
 
 
795 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.91 
 
 
757 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1709  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.42 
 
 
729 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.37084  normal  0.962823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0320  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.82 
 
 
731 aa  142  2e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.706326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.82 
 
 
656 aa  142  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.674965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2811  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  25.48 
 
 
732 aa  140  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.140611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0009  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.77 
 
 
730 aa  134  4e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0630863 
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.19 
 
 
798 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2571  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.8 
 
 
775 aa  124  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0048  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.41 
 
 
759 aa  123  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.14 
 
 
788 aa  117  9e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.681692 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0536  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.81 
 
 
651 aa  115  2e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0550  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.81 
 
 
651 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1041  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.43 
 
 
1225 aa  115  4e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.58 
 
 
676 aa  113  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0351  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.07 
 
 
789 aa  113  1e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.478958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  29.41 
 
 
736 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>