More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0045 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  77.28 
 
 
544 aa  877  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  74.35 
 
 
543 aa  847  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  73.99 
 
 
543 aa  842  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  74.35 
 
 
543 aa  847  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2080  CTP synthetase  68.09 
 
 
542 aa  773  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  74.72 
 
 
545 aa  849  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  75.05 
 
 
541 aa  842  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  77.82 
 
 
546 aa  875  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  76.91 
 
 
544 aa  874  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  100 
 
 
546 aa  1121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  57.01 
 
 
543 aa  623  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  56.62 
 
 
546 aa  618  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  55.08 
 
 
555 aa  607  1e-172  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  55.7 
 
 
543 aa  605  1e-172  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  55.64 
 
 
531 aa  605  1e-172  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  57.09 
 
 
550 aa  605  1e-172  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  55.45 
 
 
542 aa  606  1e-172  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  54.71 
 
 
555 aa  604  1e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  55.54 
 
 
547 aa  603  1e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.03 
 
 
536 aa  604  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  54.46 
 
 
534 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98786e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  55.64 
 
 
542 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.92 
 
 
531 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  53.56 
 
 
539 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.7 
 
 
555 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  55.45 
 
 
542 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  55.45 
 
 
542 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  54.04 
 
 
540 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  56.05 
 
 
544 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  55.45 
 
 
542 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  55.37 
 
 
540 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  54.76 
 
 
550 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  54.81 
 
 
544 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  54.63 
 
 
544 aa  595  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  2.54043e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  55.7 
 
 
546 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  54.93 
 
 
542 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.7 
 
 
555 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  54.93 
 
 
542 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  54.07 
 
 
551 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  54.88 
 
 
555 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  55.35 
 
 
535 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  54.7 
 
 
555 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  54.43 
 
 
538 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.41143e-09 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  54.07 
 
 
557 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  55.82 
 
 
543 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  54.09 
 
 
555 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  54.36 
 
 
542 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  54.3 
 
 
565 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  55.64 
 
 
543 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  55.64 
 
 
545 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  54.55 
 
 
547 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.17 
 
 
533 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  54.09 
 
 
530 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  54.24 
 
 
542 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  55.64 
 
 
545 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  55.82 
 
 
543 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  53.99 
 
 
547 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  54.36 
 
 
555 aa  585  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  54.14 
 
 
542 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  54.44 
 
 
543 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  53.97 
 
 
543 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  54.07 
 
 
543 aa  586  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  53.62 
 
 
546 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  54.43 
 
 
533 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.17 
 
 
533 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  54.73 
 
 
548 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  56.22 
 
 
534 aa  582  1e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  53.11 
 
 
534 aa  581  1e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  53.69 
 
 
533 aa  583  1e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  53.9 
 
 
557 aa  582  1e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.24409e-06  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  52.39 
 
 
535 aa  583  1e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  53.14 
 
 
555 aa  584  1e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  52.21 
 
 
535 aa  582  1e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.97505e-06  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  52.39 
 
 
535 aa  582  1e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  56.54 
 
 
548 aa  582  1e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  53.8 
 
 
547 aa  584  1e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  52.39 
 
 
535 aa  582  1e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  53.92 
 
 
552 aa  583  1e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  53.76 
 
 
541 aa  583  1e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  52.02 
 
 
535 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  52.02 
 
 
535 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67112e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  52.21 
 
 
535 aa  581  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  54.26 
 
 
539 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  53.23 
 
 
547 aa  581  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  52.68 
 
 
555 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  55.06 
 
 
545 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  54.17 
 
 
547 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  52.02 
 
 
535 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  54.61 
 
 
533 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  53.62 
 
 
558 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  53.15 
 
 
553 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  52.02 
 
 
535 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  54.7 
 
 
546 aa  578  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  53.78 
 
 
549 aa  581  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.82 
 
 
534 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  52.02 
 
 
535 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  54.65 
 
 
537 aa  578  1e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  54.43 
 
 
533 aa  578  1e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  54.66 
 
 
545 aa  575  1e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  54.66 
 
 
545 aa  575  1e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>