More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0042 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0042  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.15 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.65 
 
 
206 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.65 
 
 
206 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.65 
 
 
206 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.15 
 
 
206 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.65 
 
 
206 aa  120  1e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 
206 aa  120  2e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  34.16 
 
 
206 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  29.85 
 
 
212 aa  119  4e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  31.34 
 
 
212 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  29.35 
 
 
212 aa  114  8e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.49619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  31.53 
 
 
206 aa  110  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  4.92857e-05 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.49 
 
 
202 aa  108  7e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  30.15 
 
 
216 aa  107  9e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.16 
 
 
214 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 
218 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.37 
 
 
248 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  27.89 
 
 
207 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.43138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  29.47 
 
 
207 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  27.08 
 
 
214 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.12 
 
 
231 aa  105  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.31 
 
 
206 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  27.08 
 
 
214 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  27.08 
 
 
214 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
217 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  27.59 
 
 
213 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  1.97593e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.99 
 
 
235 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.99 
 
 
242 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 
206 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  26.98 
 
 
210 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  27 
 
 
215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.64 
 
 
212 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.5 
 
 
211 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  27 
 
 
215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  27 
 
 
215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  27 
 
 
215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.96 
 
 
210 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  27 
 
 
215 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31 
 
 
207 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  29.23 
 
 
207 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.35 
 
 
214 aa  101  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  26.5 
 
 
215 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.5 
 
 
211 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  25.5 
 
 
214 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.2238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  1.52892e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.92 
 
 
213 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  27.72 
 
 
215 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
211 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.69 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  26.77 
 
 
212 aa  99  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.21 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 
207 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.34 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  28.8 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  8.38099e-07 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.8 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.22 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.62 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  28.8 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  28.3 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.35 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  27.83 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.27 
 
 
201 aa  94  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.5 
 
 
201 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.17 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.54 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  28.65 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  25.12 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.75 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  28.12 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  31.31 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.93827e-09  hitchhiker  6.82503e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>