More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0041 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  70.43 
 
 
560 aa  789  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  76.91 
 
 
562 aa  894  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  73.87 
 
 
558 aa  833  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  58.63 
 
 
559 aa  675  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  72.07 
 
 
558 aa  841  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  56.96 
 
 
565 aa  638  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  60.57 
 
 
558 aa  698  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  71.22 
 
 
557 aa  824  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
559 aa  1141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  56.27 
 
 
559 aa  639  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  59.25 
 
 
558 aa  675  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  57.12 
 
 
565 aa  647  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  57.42 
 
 
565 aa  642  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  60 
 
 
557 aa  686  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  61.18 
 
 
554 aa  681  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  61.33 
 
 
557 aa  707  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  70.25 
 
 
560 aa  785  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  59.43 
 
 
558 aa  687  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  56.35 
 
 
557 aa  646  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  61.33 
 
 
557 aa  706  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  55.69 
 
 
561 aa  636  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  78.96 
 
 
557 aa  904  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  73.87 
 
 
558 aa  857  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  61.33 
 
 
557 aa  706  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  71.81 
 
 
553 aa  816  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  74.05 
 
 
558 aa  859  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  60.57 
 
 
613 aa  697  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  78.6 
 
 
582 aa  903  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  70.54 
 
 
561 aa  797  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  71.71 
 
 
561 aa  838  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  2.40463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  61.33 
 
 
557 aa  707  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  61.15 
 
 
557 aa  707  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  61.04 
 
 
557 aa  702  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  60.97 
 
 
557 aa  699  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  61.33 
 
 
557 aa  708  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  61.15 
 
 
557 aa  705  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  61.15 
 
 
557 aa  705  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  70.61 
 
 
560 aa  791  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  60.97 
 
 
557 aa  704  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  55.52 
 
 
566 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 
569 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  55.69 
 
 
579 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  56.41 
 
 
565 aa  619  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  54.38 
 
 
562 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  55.1 
 
 
580 aa  606  1e-172  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  54.38 
 
 
562 aa  603  1e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  54.38 
 
 
562 aa  603  1e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  55.04 
 
 
577 aa  604  1e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
554 aa  577  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
555 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
553 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
552 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
556 aa  554  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  50.45 
 
 
552 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
558 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  49.58 
 
 
599 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
556 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
554 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  48.76 
 
 
613 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  47.63 
 
 
619 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
555 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
554 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  50.71 
 
 
557 aa  545  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.99143e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
554 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
557 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
552 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 
563 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  48.05 
 
 
617 aa  541  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
554 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  48.52 
 
 
614 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  47.76 
 
 
613 aa  540  1e-152  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  47.93 
 
 
612 aa  541  1e-152  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  47.52 
 
 
616 aa  539  1e-152  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  47.39 
 
 
618 aa  540  1e-152  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  47.93 
 
 
612 aa  540  1e-152  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  48.35 
 
 
612 aa  539  1e-152  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0988  dihydroxy-acid dehydratase  47.39 
 
 
618 aa  540  1e-152  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 
618 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  47.69 
 
 
613 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2432  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
619 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  48.04 
 
 
556 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
555 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  47.3 
 
 
619 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3384  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 
619 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  47.38 
 
 
925 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
559 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  47.95 
 
 
612 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4135  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 
619 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0713209  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 
619 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  47.29 
 
 
619 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5037  dihydroxy-acid dehydratase  47.14 
 
 
619 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.533366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2694  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 
619 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  46.7 
 
 
615 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  47.36 
 
 
615 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
618 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
555 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  1.09399e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2305  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 
619 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270143  hitchhiker  3.64232e-08 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3546  dihydroxy-acid dehydratase  46.72 
 
 
619 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108366  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4027  dihydroxy-acid dehydratase  46.72 
 
 
619 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.428088 
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
555 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>