25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0040 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0040  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  190  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0352  hypothetical protein  53.93 
 
 
93 aa  103  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1311  hypothetical protein  52.22 
 
 
94 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328492  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2961  hypothetical protein  56.82 
 
 
93 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0482  hypothetical protein  50.56 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  4.3148e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0295  hypothetical protein  54.55 
 
 
93 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0311  hypothetical protein  55.68 
 
 
93 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.34678  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7032  hypothetical protein  48.86 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00925543  normal  0.081206 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0655  hypothetical protein  53.93 
 
 
94 aa  82  3e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0156  hypothetical protein  52.75 
 
 
94 aa  80.9  6e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4454  transcriptional regulator, Fis family  54.44 
 
 
95 aa  80.5  7e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121305  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3584  hypothetical protein  54.95 
 
 
98 aa  80.1  8e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1854  hypothetical protein  54.95 
 
 
98 aa  80.1  8e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703432  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4064  hypothetical protein  54.95 
 
 
98 aa  80.1  9e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3471  hypothetical protein  56.18 
 
 
94 aa  79.7  1e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3340  hypothetical protein  53.85 
 
 
98 aa  78.2  3e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.652813  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3974  Fis family transcriptional regulator  53.33 
 
 
95 aa  78.6  3e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4177  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  76.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4190  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  76.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2964  Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 
103 aa  75.9  2e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0607  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  75.5  2e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1578  hypothetical protein  53.85 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.06064e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1002  hypothetical protein  46.51 
 
 
115 aa  70.1  9e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0256071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1498  hypothetical protein  49.21 
 
 
74 aa  59.3  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.743357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>