101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0034 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  49.16 
 
 
190 aa  182  2e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  46.51 
 
 
481 aa  164  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  44.07 
 
 
188 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  48 
 
 
484 aa  140  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  6.52798e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  44.44 
 
 
197 aa  139  2e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  4.3141e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  45.14 
 
 
464 aa  139  2e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  48.59 
 
 
202 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  2.39673e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  48.59 
 
 
202 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  48.28 
 
 
180 aa  135  3e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  42.7 
 
 
194 aa  131  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  42.05 
 
 
213 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  39.29 
 
 
202 aa  119  2e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  40.88 
 
 
202 aa  115  4e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  41.01 
 
 
447 aa  114  9e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  36.36 
 
 
254 aa  112  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  41.01 
 
 
447 aa  113  2e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  37.59 
 
 
200 aa  104  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  33.9 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  34.68 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  39.52 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  35.33 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  7.03212e-15  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  36.36 
 
 
191 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  33.55 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  32.75 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  35.44 
 
 
208 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  34.57 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  36.62 
 
 
198 aa  87.8  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  36.3 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  34.18 
 
 
208 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  32.92 
 
 
202 aa  84.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  38.03 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  35.71 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  38.03 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  35.77 
 
 
203 aa  84  1e-15  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  37.66 
 
 
221 aa  84  1e-15  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  32.95 
 
 
213 aa  83.6  2e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  34.81 
 
 
203 aa  83.2  2e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  37.5 
 
 
203 aa  83.2  2e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  38.99 
 
 
191 aa  82.4  3e-15  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  33.85 
 
 
205 aa  81.6  5e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  32.97 
 
 
187 aa  81.6  5e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  32.52 
 
 
183 aa  80.9  9e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  30.49 
 
 
185 aa  80.5  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.24473e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  31.25 
 
 
191 aa  80.1  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  36.88 
 
 
183 aa  80.1  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  32.94 
 
 
522 aa  78.6  4e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  35.34 
 
 
470 aa  79  4e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  33.12 
 
 
200 aa  78.2  6e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  31.21 
 
 
183 aa  77.8  8e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.46429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  32.34 
 
 
184 aa  77  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  36.03 
 
 
211 aa  76.3  2e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  31.1 
 
 
181 aa  76.6  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  31.29 
 
 
183 aa  75.9  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.24046e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  30.54 
 
 
179 aa  75.5  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  28.88 
 
 
187 aa  75.9  3e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  36.72 
 
 
179 aa  75.1  5e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  31.74 
 
 
184 aa  74.3  8e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  36.13 
 
 
219 aa  73.6  1e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  34.01 
 
 
459 aa  73.9  1e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  30.73 
 
 
451 aa  73.2  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  29.21 
 
 
233 aa  72  4e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  32.04 
 
 
224 aa  72  5e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  35.43 
 
 
208 aa  70.5  1e-11  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  28.74 
 
 
182 aa  70.5  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  29.31 
 
 
438 aa  70.1  1e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  31.74 
 
 
184 aa  70.5  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  32.52 
 
 
174 aa  70.5  1e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  32.41 
 
 
466 aa  70.1  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.14729e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  32.7 
 
 
221 aa  69.7  2e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  6.37558e-05 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  30.14 
 
 
186 aa  68.6  4e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  31.25 
 
 
462 aa  68.6  5e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  32.82 
 
 
467 aa  67  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  33.55 
 
 
213 aa  67  1e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  30 
 
 
174 aa  65.1  5e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.9521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  30 
 
 
174 aa  65.1  5e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.32449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  65.1  6e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  28.42 
 
 
220 aa  63.2  2e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  33.81 
 
 
172 aa  63.2  2e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  33.96 
 
 
468 aa  63.5  2e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  35.07 
 
 
187 aa  62.4  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  37.5 
 
 
420 aa  62.8  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  25.41 
 
 
189 aa  60.5  1e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  28.25 
 
 
438 aa  59.7  2e-08  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  34.75 
 
 
174 aa  59.3  3e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  34.75 
 
 
174 aa  59.3  3e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  28.66 
 
 
438 aa  58.9  4e-08  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  34.04 
 
 
436 aa  58.9  4e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  32.61 
 
 
172 aa  58.9  4e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  32.26 
 
 
173 aa  56.6  2e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  29.29 
 
 
463 aa  56.2  3e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  30.23 
 
 
468 aa  54.7  6e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  28.86 
 
 
467 aa  54.7  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  33.64 
 
 
474 aa  53.5  2e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  31.61 
 
 
211 aa  52.8  3e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  33.08 
 
 
196 aa  52  5e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  31.45 
 
 
180 aa  51.2  7e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  31.75 
 
 
481 aa  51.2  8e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0319  AMMECR1 domain-containing protein  31.67 
 
 
224 aa  50.4  1e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.520207  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  38.67 
 
 
458 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>